Menurut tradisi, Santo Markus mendirikan Gereja di Alexandria, Mesir, dan menjadi Uskup di sana. Dalam dunia seni, Santo Markus dilambangkan dengan seekor singa yang bersayap (kebangkitan). Karena Markus mengawali Injil dengan “suara yang berseru-seru di padang gurun” (bdk. Mrk.1:3) Ada suara orang yang berseru-seru di padang gurun, “Persiapkanlah jalan untuk Tuhan, luruskanlah jalan bagi-Nya.” Singa juga melambangkan jabatan rajawi, suatu simbol yang tepat bagi Putra Allah.

Singa bersayap merupakan lambang Yayasan Santo Markus,  menurut Injil :

1. Posisi singa menggambarkan keadaan siaga,sebagai sikap siaga dalam menghadapi berbagai tantangan dalam memperjuangkan masa depan
2. Mata tajam menatap kedepan menggambarkan keyakinan,optimisme dan pancaran kekuatan jiwa
3. Singa mengaum dalam ekspresi garang menggambarkan Santo Markus sebagai singa yang mengaum dipadang pasir
4. Warna kuning (emas)/Lemon yellow pada logo menggambarkan keagungan .
5. Warna Merah pada latar belakang menggambarkan semangat yang terus menyala
6. Lingkaran putih pada kepala singa menggambarkan kesucian
7. Warna putih pada garis lurus (garis yang diapit dua garis hitam) dan pada latar tulisan Santo Markus menggambarkan ketulusan dan kesucian yang melatar-belakangi perjuangan,Visi dan misi Yayasan Santo Markus